综合办公室是现代教育技术中心的综合事务管理部门，负责中心内外联系以及承上启下的工作，其主要包括文书处理、档案管理、考勤管理、人事管理、非事业用工的薪资管理、资产管理等事务性工作，此外，还兼负责中心的对外联系工作。

综合办公室工作内容具体包含：负责中心工作过程中综合事务的处理工作，为中心的正常运作提供良好的环境；为中心其他部门的正常工作提供良好可靠的后勤保障；负责中心文书、证件、档案、印鉴、内部文件的起草、收发、管理工作；负责办公用品、文具、劳保福利用品的采购、等级和发放工作；做好网站建设、信息收集、分析、归档，搞好中心的对外宣传；负责中心固定资产及低值易耗品的管理等级；协调好中心与学校各职能部门的关系；负责中心的劳动人事、消防安全、考勤制度的管理工作等。